Available Theses & Projects, Teaching Courses

Research Training Group (RTG) - "MoNN&Di" - Monoaminergic Neuronal Networks & Disease

The goal of MoNN_&Di is to create a focused 4 year doctoral training programme that enables scrutiny of how monoaminergic neuromodulators influence neuronal circuits and shape behavioral responses.

For application form and further project info see MoNN_&Di, deadline 31. April 2023

Phd Project

Cross-modal intracortical dynamics and plasticity during learning in virtual reality

in Collaboration with Prof. Thomas Knöpfel, Imperial College London, UK

Representations in the cortex are highly dynamic and depend on the actual cortical state bound to task specificity within multi-dimensional context. Our approach rests on the hypothesis that repetitive use leaves persistent traces in adult cortical networks that can be visualized as spatial or spatiotemporal patterns using wide field optical imaging methods. To measure complex cortical dynamics across multiple brain areas simultaneously we will exploit recent developments of mouse models that express voltage indicators intrinsically.

Master Thesis - Phd Project

“I-See” - EU-funded PhD position in Neurophysiology

This multidisciplinary project brings together scientists from different fields and complementary experimental and theoretical know-how. The project part of the PhD position (see job posting) comprises electrical stimulation in the mouse brain combined with cutting-edge (optogenetic) voltage-sensitive dye imaging techniques (Knöpfel Lab, Imperial College London). The aim of our international consortium (Switzerland, Canada, and Germany) is to improve the ability of cortical prostheses to 'mimic' the language of the brain and increase the safety and longevity of visual prosthetic devices.

Public Video on Youtube (in German)

Phd Project

Einfluss von Serotonin auf die Informations-Verarbeitung im Kortex der Maus

Master-Arbeit zu vergeben in Kooperation mit Prof. Stefan Herlitze, Lehrstuhl für Allgemeine Zoologie und Neurobiologie

Master Thesis

Bachelor-Thesis, Machine Learning

sorry, position filled March 2022 - Using Deep Neural Network (DNN) to automatize tracking of Eye and Body Movements of Mice.

Bachelor-Thesis, Study Project

In cooperation with Tobias Glasmachers (INI, Head of Machine Learning Group)

Eye-tracking - movements and changing pupil size in mice - to get some inspiration see original developer's page at http://www.mackenziemathislab.org/dlc-modelzoo

S-Modul

"Sehen, Tasten, Lernen – Neurophysiology of Sensory Processing"

Verz. 310 049 / 310 549

Nach Abschluss des Moduls verfügen die Studierenden über Grundlagenwissen zum Verständnis neuronaler Strukturen und Funktion, insbesondere im Hinblick auf sensorische Informationsverarbeitung in der Großhirnrinde sowie über Grundlagen neuronaler Plastizität (Seminarvortrag). Zudem haben die Studierenden „hands-on“ Methoden im Bereich extrazellulärer und optischer Nervenzellableitungen, sowie Registrierung und Auswertung neuronaler Daten erlernt. Darüber hinaus haben sie allgemeinere Qualifikationen wie Präsentations- und Vortragstechniken, Teamfähigkeit, Umgang mit Rechnern und Auswerteprogrammen (Matlab, Phyton) erworben (Protokoll und Abschlussvortrag).

Teilnahmevoraussetzung

Grundmodulprüfungen der Bachelorstudiengänge der RUB (B.A., B.Sc.) oder Bachelor Abschluss

S-Modul

"Activation Dynamics in Sensory Brain Areas"

Verz. 310 349 / 310 849

Nach Abschluss des Moduls verfügen die Studierenden über Grundlagenwissen zum Verständnis neuronaler Strukturen und Funktion, insbesondere im Hinblick auf sensorische Informationsverarbeitung in der Großhirnrinde (Seminarvortrag).

Mittels der Einführung in experimentelle Techniken und an theoretische Herangehensweisen werden die Studierenden über ein grundlegendes Verständnis zur Erforschung von Gehirnfunktionen und deren Abstraktion in mathematischen Modellen verfügen (Protokoll).

Teilnahmevoraussetzung

Grundmodulprüfungen der Bachelorstudiengänge der RUB (B.A., B.Sc.) oder Bachelor Abschluss

A-Modul

Teil des A-Moduls "Neuronale Signale auf der Ebene von Kanal, Zelle und System"

Fakultät für Biologie und Biotechnologie, Verz. 190 020/21/22 (Vorlesung/Blockpraktikum/Seminar)

Herlitze, Spoida, Mark, Jancke

Teilnahmevoraussetzung

Grundmodulprüfungen der Bachelorstudiengänge der RUB (B.A., B.Sc.) oder Bachelor Abschluss

RUB-China Scholarship Council (CSC)

Our lab participates in a new call offered by the RUB to attract students from China.

Projects that we offer in this framework:

(1) Developing intracortical visual prostheses

(2) Manipulating brain dynamics through serotonin

See for more info

Phd Project

Optical Imaging Projects, Master-Thesis in Physics and Biology

Einfluss der Extrazellulärmatrix auf die Aktivitätsausbreitung im visuellen Kortex der Maus.

Master ThesisStudy Project